该寺位于拉萨八廓街南面林廓路附近，饶赛四的东面。据说，为了防御吉曲河的洪水在今寺庙所在地下凿开了一个地方，并用石板铺成地面供赞布松赞干布打坐修行。这就是为什么叫作“阿尼仓空”的原因。
走进仓姑寺大门，首先是一排并不长的转经桶和畏桑塔，主佛殿就坐落在迎门左侧一点。细心的尼姑们把这个家园，收拾得整齐干净，清洁幽静。
仓姑寺有着与众不同的传统和风格，这里不仅是女性佛者的乐园，同时也是一些社会中的女性们学习佛教、文化和各种知识的场所。这里曾经培养了很多有影响的人物，寺内现有尼众百余人之多。这里的尼姑每天早晨8点都会准时在经堂颂经，就是专业的“会供仪式”，这个过程大概要持续到下午，每个月还有几次规模比较大的集体颂经法事。寺内的面积不算大，甚至有一些局促，分上下，上面是经堂，下面是一些日常用地，殿的正门有漂亮的石阶，一切都安排得井井有条，你一眼看过去，就会有“干净”“清洁”的字眼跳到脑海里。
说起仓姑寺的历史，人们习惯上把它追溯到公元七世纪的吐蕃王朝时期。传说，那个时候一到夏季，拉萨河上游各个山谷的洪水都顺势而下汇集到了拉萨河，造成拉萨河水突然的暴涨，于是经常发生水灾，殃及两岸的农田和村庄，给广大老百姓带来了巨大的灾难和损失。为了消除拉萨河水给百姓和拉萨城造成的危害，藏王松赞干布就在拉萨河的河堤上挖了一个地洞，闭关诵经，祈愿消除水患，人民安居，百姓幸福。后来人们把藏王松赞干布修行过的地洞称为“仓姑”，也就是地洞的意思。
公元十二世纪，一位人们称为神医的杰瓦奔在修行洞曾闭关修行，据说，得此大成就，使得这个早已闻名的修行洞更加盛名远播。到了公元十五世纪，宗喀巴大师的得意弟子古觉多丹在修行洞的基础上正式修建了仓姑寺，不过那时寺院的规模并不很大。直到公元二十世纪初，帕崩岗仁波钦和第九世甘丹寺赤巴强巴曲扎出资大规模的扩建，逐渐形成了今天的规模。
解放前，不少贵族都将女儿送进仓姑寺修行，为的是逃避嫁女时所出的高额嫁妆，西藏女作家曲珍的小说《无性别的神》中，女主角央珍卓玛便是遭此命运的不幸女性。与其他出身贫苦得四处化缘的阿尼不同，这些贵族小姐住在父兄修建的小楼中，不光可以免除劳役之苦，甚至还有仆人服侍。青灯古佛的修炼压抑不了追求爱情的心，不少贵族阿尼都私下与情人有往来，甚至将他们带到寺中私会。西藏有首歌谣，据说形象归纳了拉萨四座阿尼庙的特点：“米钦热寺的尼姑，在悬崖顶上修行；嘎丽寺的尼姑，在深山沟里放牧；朗古寺的尼姑，在佛堂里边喝酒；唯有仓姑寺的尼姑，既有佛法的修行，又过世俗的生活。”
如今的仓姑寺美丽雅致，鲜花怒放，阿尼个个都面带喜色且态度和善。作为女众道场，仓姑寺注重传承和弘扬观音菩萨和度母信仰的法事与仪轨。比如寺院经常举行的会供仪式是“度母会供仪轨”、“瑜伽母修持仪轨”、“尊胜佛母长寿仪轨”等。按照寺院的要求，每天8点在经堂举行“日常课诵”，即会供仪式，一直到下午4点结束。每个月要举行七次较大型的集体诵经法会。
该寺的127名尼姑每年“萨噶达瓦节”时，都要进行斋戒，只进8种白食，修行格鲁派的显密二宗。
仓姑寺主佛殿的面积并不很大，分上下两层，上层是经堂。殿门沿台阶而上，殿门两边绘有四大天王壁画，屋檐和门柱雕饰，几乎与其他藏传佛教寺院相同。门柱上方，则是传统的狮面和人面柱头像。仓姑寺主供十一面观音菩萨，另有文殊菩萨、无量寿佛、宗喀巴大师和十三幅明清以来唐卡等。
仓姑寺最著名的是主佛殿一层地下的松赞干布修行洞。洞内供奉着吐蕃国王松赞干布塑像，每天有3名专职的尼姑在这里，按时诵经祈祷，摆放供品，或是替换灯油。多少个世纪以来，这个古老神圣的修行洞，不知迎来送往了多少来自各地的香客和朝圣者，接受着信徒们的顶礼膜拜直到今天
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